prof. RNDr. Jiří Šponer, DrSc.

2005

• RNA Kink-turns as Flexible Molecular Hinges of the Ribosomal "LEGO". The Role of Second A-minor Motif and Nominally Unpaired Bases

  RÁZGA Filip KOČA Jaroslav LEONTIS N.B. ŠPONER Jiří

  Článek ve sborníku

  14th Conference on Current Trends in Computational Chemistry 2005, rok: 2005

• RNA K-turns-Flexible Ribosomal Motifs:Dynamics, Hydration, Conformations and Biological Relevance

  RÁZGA Filip KOČA Jaroslav LEONTIS Neocles B ŠPONER Jiří

  Článek ve sborníku

  Workshop on Modeling Interactions in Biomolecules II, rok: 2005

2004

• Long-residency hydration, cation binding and dynamics of Loop E/Helix IV rRNA - L25 protein complex

  RÉBLOVÁ Kamila SPACKOVÁ Nadezda KOČA Jaroslav LEONTIS Neocles SPONER Jiri

  Článek v odborném periodiku

  Biophysical Journal, rok: 2004, ročník: 87, vydání: 5

• Molecular dynamics simulations of guanine quadruplex loops:Advances and force field limitations

  FADRNÁ Eva ŠPAČKOVÁ Naděžda ŠTEFL Richard KOČA Jaroslav CHEATHAM Thomas E. ŠPONER Jiří

  Článek v odborném periodiku

  Biophysical Journal, rok: 2004, ročník: 87, vydání: 1

• Molekulově Dynamická simulace flexibilních RNA motivů

  RÁZGA Filip KOČA Jaroslav ŠPONER Jiří LEONTIS Neocles B.

  Článek ve sborníku

  Sborník abstraktů Studentská vědecká konference v oboru chemie a biochemie, rok: 2004

• Ribosomal RNA Kink-turn Motif - A Flexible Molecular Hinge

  RÁZGA Filip ŠPAČKOVÁ Naďa RÉBLOVÁ Kamila KOČA Jaroslav LEONTIS Neocles B. ŠPONER Jiří

  Článek v odborném periodiku

  Journal of Biomolecular Structure & Dynamics, rok: 2004, ročník: 22, vydání: 2

• Ribosomal RNA Kink-turn motif - a flexible molecular hinge

  RÁZGA Filip ŠPAČKOVÁ Naděžda RÉBLOVÁ Kamila KOČA Jaroslav LEONTIS Neocles B. ŠPONER Jiří

  Článek ve sborníku

  Conference on Current Trends in Computational Chemistry, rok: 2004

2003

• Conformational Flexibility of DNA sequences studied by Advanced Molecular Mechanics and Dynamics Tools

  FADRNÁ Eva ŠPAČKOVÁ Naděžda ŠPONER Jiří KOČA Jaroslav

  Článek ve sborníku

  Book of Abstracts, rok: 2003

• Formation Pathways of a Guanine-Quadruplex DNA Revealed by Molecular Dynamics and Thermodynamics Analysis of the Substates

  ŠTEFL Richard CHEATHAM Thomas E. ŠPAČKOVÁ Naděžda FADRNÁ Eva BERGER Imre KOČA Jaroslav ŠPONER Jiří

  Článek v odborném periodiku

  Biophysical Journal, rok: 2003, ročník: 85, vydání: 3

• Molecular Dynamics of Guanine Quadruplex Molecules

  ŠPAČKOVÁ Naděžda ŠTEFL Richard BERGER Imre FADRNÁ Eva KOČA Jaroslav CHEATHAM III T.E. ŠPONER Jiří

  Článek ve sborníku

  Book of Abstracts, rok: 2003